Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVR3

C7orf43, Uncharacterized protein C7orf43, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C7orf43Q8WVR3 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C7orf43Q8WVR3 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C7orf43Q8WVR3 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C7orf43Q8WVR3 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C7orf43Q8WVR3 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C7orf43Q8WVR3 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C7orf43Q8WVR3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C7orf43Q8WVR3 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C7orf43Q8WVR3 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C7orf43Q8WVR3 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C7orf43Q8WVR3 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C7orf43Q8WVR3 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C7orf43Q8WVR3 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C7orf43Q8WVR3 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C7orf43Q8WVR3 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C7orf43Q8WVR3 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C7orf43Q8WVR3 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C7orf43Q8WVR3 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C7orf43Q8WVR3 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C7orf43Q8WVR3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C7orf43Q8WVR3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C7orf43Q8WVR3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C7orf43Q8WVR3 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C7orf43Q8WVR3 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C7orf43Q8WVR3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C7orf43Q8WVR3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
C7orf43Q8WVR3 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C7orf43Q8WVR3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
C7orf43Q8WVR3 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
C7orf43Q8WVR3 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
C7orf43Q8WVR3 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
C7orf43Q8WVR3 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
C7orf43Q8WVR3 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C7orf43Q8WVR3 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
C7orf43Q8WVR3 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C7orf43Q8WVR3 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C7orf43Q8WVR3 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
C7orf43Q8WVR3 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
C7orf43Q8WVR3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C7orf43Q8WVR3 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
C7orf43Q8WVR3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
C7orf43Q8WVR3 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C7orf43Q8WVR3 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C7orf43Q8WVR3 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C7orf43Q8WVR3 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C7orf43Q8WVR3 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C7orf43Q8WVR3 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C7orf43Q8WVR3 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C7orf43Q8WVR3 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C7orf43Q8WVR3 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C7orf43Q8WVR3 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C7orf43Q8WVR3 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C7orf43Q8WVR3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
C7orf43Q8WVR3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C7orf43Q8WVR3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C7orf43Q8WVR3 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C7orf43Q8WVR3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C7orf43Q8WVR3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C7orf43Q8WVR3 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C7orf43Q8WVR3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C7orf43Q8WVR3 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C7orf43Q8WVR3 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C7orf43Q8WVR3 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C7orf43Q8WVR3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C7orf43Q8WVR3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C7orf43Q8WVR3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C7orf43Q8WVR3 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C7orf43Q8WVR3 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
C7orf43Q8WVR3 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C7orf43Q8WVR3 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C7orf43Q8WVR3 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C7orf43Q8WVR3 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C7orf43Q8WVR3 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C7orf43Q8WVR3 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
C7orf43Q8WVR3 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C7orf43Q8WVR3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C7orf43Q8WVR3 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C7orf43Q8WVR3 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C7orf43Q8WVR3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C7orf43Q8WVR3 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C7orf43Q8WVR3 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C7orf43Q8WVR3 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C7orf43Q8WVR3 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C7orf43Q8WVR3 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C7orf43Q8WVR3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C7orf43Q8WVR3 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C7orf43Q8WVR3 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C7orf43Q8WVR3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C7orf43Q8WVR3 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C7orf43Q8WVR3 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C7orf43Q8WVR3 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C7orf43Q8WVR3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C7orf43Q8WVR3 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C7orf43Q8WVR3 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C7orf43Q8WVR3 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C7orf43Q8WVR3 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C7orf43Q8WVR3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C7orf43Q8WVR3 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C7orf43Q8WVR3 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C7orf43Q8WVR3 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms