Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCQ3

LINC00301, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00301, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00301Q8NCQ3 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LINC00301Q8NCQ3 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms