Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA58

PNLDC1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNLDC1Q8NA58 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PNLDC1Q8NA58 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms