Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNE4Q8N205 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNE4Q8N205 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNE4Q8N205 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNE4Q8N205 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNE4Q8N205 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYNE4Q8N205 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYNE4Q8N205 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYNE4Q8N205 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYNE4Q8N205 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYNE4Q8N205 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYNE4Q8N205 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYNE4Q8N205 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYNE4Q8N205 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYNE4Q8N205 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYNE4Q8N205 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYNE4Q8N205 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYNE4Q8N205 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYNE4Q8N205 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SYNE4Q8N205 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYNE4Q8N205 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYNE4Q8N205 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYNE4Q8N205 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYNE4Q8N205 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYNE4Q8N205 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYNE4Q8N205 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYNE4Q8N205 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYNE4Q8N205 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYNE4Q8N205 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNE4Q8N205 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNE4Q8N205 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNE4Q8N205 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNE4Q8N205 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNE4Q8N205 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNE4Q8N205 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNE4Q8N205 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNE4Q8N205 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNE4Q8N205 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNE4Q8N205 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNE4Q8N205 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNE4Q8N205 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNE4Q8N205 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNE4Q8N205 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNE4Q8N205 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNE4Q8N205 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNE4Q8N205 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNE4Q8N205 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNE4Q8N205 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNE4Q8N205 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNE4Q8N205 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYNE4Q8N205 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYNE4Q8N205 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SYNE4Q8N205 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYNE4Q8N205 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYNE4Q8N205 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYNE4Q8N205 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYNE4Q8N205 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYNE4Q8N205 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SYNE4Q8N205 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYNE4Q8N205 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SYNE4Q8N205 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYNE4Q8N205 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYNE4Q8N205 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYNE4Q8N205 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYNE4Q8N205 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYNE4Q8N205 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYNE4Q8N205 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYNE4Q8N205 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYNE4Q8N205 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYNE4Q8N205 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYNE4Q8N205 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYNE4Q8N205 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYNE4Q8N205 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYNE4Q8N205 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYNE4Q8N205 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYNE4Q8N205 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYNE4Q8N205 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYNE4Q8N205 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SYNE4Q8N205 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYNE4Q8N205 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYNE4Q8N205 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SYNE4Q8N205 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYNE4Q8N205 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYNE4Q8N205 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYNE4Q8N205 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYNE4Q8N205 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYNE4Q8N205 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SYNE4Q8N205 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SYNE4Q8N205 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SYNE4Q8N205 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYNE4Q8N205 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYNE4Q8N205 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYNE4Q8N205 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYNE4Q8N205 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYNE4Q8N205 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYNE4Q8N205 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYNE4Q8N205 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYNE4Q8N205 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SYNE4Q8N205 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYNE4Q8N205 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms