Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ANKRD54Q6NXT1 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ANKRD54Q6NXT1 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ANKRD54Q6NXT1 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ANKRD54Q6NXT1 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ANKRD54Q6NXT1 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ANKRD54Q6NXT1 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ANKRD54Q6NXT1 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ANKRD54Q6NXT1 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ANKRD54Q6NXT1 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ANKRD54Q6NXT1 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ANKRD54Q6NXT1 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ANKRD54Q6NXT1 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ANKRD54Q6NXT1 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ANKRD54Q6NXT1 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ANKRD54Q6NXT1 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD54Q6NXT1 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD54Q6NXT1 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD54Q6NXT1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD54Q6NXT1 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD54Q6NXT1 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD54Q6NXT1 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD54Q6NXT1 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD54Q6NXT1 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD54Q6NXT1 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD54Q6NXT1 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD54Q6NXT1 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD54Q6NXT1 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD54Q6NXT1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD54Q6NXT1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD54Q6NXT1 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD54Q6NXT1 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD54Q6NXT1 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD54Q6NXT1 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD54Q6NXT1 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD54Q6NXT1 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD54Q6NXT1 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD54Q6NXT1 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD54Q6NXT1 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD54Q6NXT1 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD54Q6NXT1 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD54Q6NXT1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD54Q6NXT1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD54Q6NXT1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD54Q6NXT1 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD54Q6NXT1 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD54Q6NXT1 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD54Q6NXT1 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD54Q6NXT1 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD54Q6NXT1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD54Q6NXT1 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD54Q6NXT1 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD54Q6NXT1 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD54Q6NXT1 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ANKRD54Q6NXT1 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ANKRD54Q6NXT1 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ANKRD54Q6NXT1 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ANKRD54Q6NXT1 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ANKRD54Q6NXT1 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ANKRD54Q6NXT1 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ANKRD54Q6NXT1 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ANKRD54Q6NXT1 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ANKRD54Q6NXT1 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ANKRD54Q6NXT1 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ANKRD54Q6NXT1 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ANKRD54Q6NXT1 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ANKRD54Q6NXT1 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ANKRD54Q6NXT1 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ANKRD54Q6NXT1 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ANKRD54Q6NXT1 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ANKRD54Q6NXT1 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ANKRD54Q6NXT1 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ANKRD54Q6NXT1 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ANKRD54Q6NXT1 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ANKRD54Q6NXT1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ANKRD54Q6NXT1 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD54Q6NXT1 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD54Q6NXT1 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD54Q6NXT1 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD54Q6NXT1 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD54Q6NXT1 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD54Q6NXT1 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD54Q6NXT1 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD54Q6NXT1 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD54Q6NXT1 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD54Q6NXT1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD54Q6NXT1 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD54Q6NXT1 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD54Q6NXT1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD54Q6NXT1 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD54Q6NXT1 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD54Q6NXT1 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD54Q6NXT1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD54Q6NXT1 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD54Q6NXT1 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD54Q6NXT1 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD54Q6NXT1 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD54Q6NXT1 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD54Q6NXT1 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD54Q6NXT1 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms