Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXP0

EFCAB12, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB12Q6NXP0 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC21.3■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC21.3■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.29■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC21.28■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC21.28■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC21.28■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.27■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.27■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC21.27■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC21.27■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC21.27■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EFCAB12Q6NXP0 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
EFCAB12Q6NXP0 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EFCAB12Q6NXP0 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EFCAB12Q6NXP0 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EFCAB12Q6NXP0 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EFCAB12Q6NXP0 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms