Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU3

CHIC1, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC1Q5VXU3 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CHIC1Q5VXU3 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CHIC1Q5VXU3 LINC02347-203ENST00000540774 1442 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CHIC1Q5VXU3 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CHIC1Q5VXU3 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
CHIC1Q5VXU3 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CHIC1Q5VXU3 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CHIC1Q5VXU3 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CHIC1Q5VXU3 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CHIC1Q5VXU3 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CHIC1Q5VXU3 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CHIC1Q5VXU3 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
CHIC1Q5VXU3 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CHIC1Q5VXU3 CDC23-201ENST00000394884 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CHIC1Q5VXU3 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CHIC1Q5VXU3 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CHIC1Q5VXU3 AC092801.1-201ENST00000443763 581 ntTSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CHIC1Q5VXU3 AC012454.1-201ENST00000443948 995 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
CHIC1Q5VXU3 AC018635.1-201ENST00000468292 1030 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
CHIC1Q5VXU3 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CHIC1Q5VXU3 AP001198.2-201ENST00000593121 466 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CHIC1Q5VXU3 AC023510.2-201ENST00000622162 746 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
CHIC1Q5VXU3 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CHIC1Q5VXU3 RFC1-217ENST00000639695 867 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CHIC1Q5VXU3 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
CHIC1Q5VXU3 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CHIC1Q5VXU3 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CHIC1Q5VXU3 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CHIC1Q5VXU3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CHIC1Q5VXU3 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
CHIC1Q5VXU3 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CHIC1Q5VXU3 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CHIC1Q5VXU3 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
CHIC1Q5VXU3 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CHIC1Q5VXU3 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CHIC1Q5VXU3 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CHIC1Q5VXU3 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CHIC1Q5VXU3 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CHIC1Q5VXU3 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CHIC1Q5VXU3 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CHIC1Q5VXU3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CHIC1Q5VXU3 GPALPP1-203ENST00000379151 1393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CHIC1Q5VXU3 NFE2L2-204ENST00000423513 1382 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CHIC1Q5VXU3 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CHIC1Q5VXU3 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CHIC1Q5VXU3 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CHIC1Q5VXU3 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CHIC1Q5VXU3 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CHIC1Q5VXU3 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CHIC1Q5VXU3 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CHIC1Q5VXU3 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CHIC1Q5VXU3 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
CHIC1Q5VXU3 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CHIC1Q5VXU3 AP003041.2-201ENST00000525666 1180 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
CHIC1Q5VXU3 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CHIC1Q5VXU3 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CHIC1Q5VXU3 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CHIC1Q5VXU3 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CHIC1Q5VXU3 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CHIC1Q5VXU3 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CHIC1Q5VXU3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CHIC1Q5VXU3 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CHIC1Q5VXU3 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CHIC1Q5VXU3 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
CHIC1Q5VXU3 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
CHIC1Q5VXU3 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
CHIC1Q5VXU3 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
CHIC1Q5VXU3 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
CHIC1Q5VXU3 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
CHIC1Q5VXU3 MGST1-204ENST00000396209 979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
CHIC1Q5VXU3 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.91
CHIC1Q5VXU3 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
CHIC1Q5VXU3 AC005520.3-201ENST00000602874 370 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
CHIC1Q5VXU3 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
CHIC1Q5VXU3 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
CHIC1Q5VXU3 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
CHIC1Q5VXU3 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
CHIC1Q5VXU3 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CHIC1Q5VXU3 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CHIC1Q5VXU3 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CHIC1Q5VXU3 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CHIC1Q5VXU3 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CHIC1Q5VXU3 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CHIC1Q5VXU3 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CHIC1Q5VXU3 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CHIC1Q5VXU3 ATOX1-206ENST00000522710 591 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CHIC1Q5VXU3 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CHIC1Q5VXU3 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CHIC1Q5VXU3 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CHIC1Q5VXU3 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CHIC1Q5VXU3 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CHIC1Q5VXU3 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CHIC1Q5VXU3 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CHIC1Q5VXU3 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CHIC1Q5VXU3 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CHIC1Q5VXU3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CHIC1Q5VXU3 ATG10-IT1-201ENST00000396880 487 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
CHIC1Q5VXU3 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CHIC1Q5VXU3 MTCYBP11-201ENST00000447254 1109 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
CHIC1Q5VXU3 CREM-228ENST00000473940 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms