Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYE7

NHSL1, NHS-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL1Q5SYE7 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NHSL1Q5SYE7 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NHSL1Q5SYE7 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NHSL1Q5SYE7 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NHSL1Q5SYE7 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NHSL1Q5SYE7 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NHSL1Q5SYE7 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NHSL1Q5SYE7 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NHSL1Q5SYE7 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NHSL1Q5SYE7 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NHSL1Q5SYE7 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NHSL1Q5SYE7 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NHSL1Q5SYE7 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NHSL1Q5SYE7 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NHSL1Q5SYE7 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
NHSL1Q5SYE7 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NHSL1Q5SYE7 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NHSL1Q5SYE7 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NHSL1Q5SYE7 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NHSL1Q5SYE7 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NHSL1Q5SYE7 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NHSL1Q5SYE7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NHSL1Q5SYE7 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NHSL1Q5SYE7 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NHSL1Q5SYE7 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NHSL1Q5SYE7 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NHSL1Q5SYE7 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NHSL1Q5SYE7 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NHSL1Q5SYE7 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
NHSL1Q5SYE7 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NHSL1Q5SYE7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NHSL1Q5SYE7 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NHSL1Q5SYE7 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NHSL1Q5SYE7 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NHSL1Q5SYE7 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NHSL1Q5SYE7 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NHSL1Q5SYE7 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
NHSL1Q5SYE7 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NHSL1Q5SYE7 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NHSL1Q5SYE7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NHSL1Q5SYE7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NHSL1Q5SYE7 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NHSL1Q5SYE7 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NHSL1Q5SYE7 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NHSL1Q5SYE7 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NHSL1Q5SYE7 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NHSL1Q5SYE7 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NHSL1Q5SYE7 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
NHSL1Q5SYE7 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
NHSL1Q5SYE7 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NHSL1Q5SYE7 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NHSL1Q5SYE7 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
NHSL1Q5SYE7 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NHSL1Q5SYE7 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NHSL1Q5SYE7 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NHSL1Q5SYE7 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NHSL1Q5SYE7 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NHSL1Q5SYE7 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NHSL1Q5SYE7 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NHSL1Q5SYE7 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NHSL1Q5SYE7 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NHSL1Q5SYE7 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NHSL1Q5SYE7 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NHSL1Q5SYE7 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NHSL1Q5SYE7 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NHSL1Q5SYE7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NHSL1Q5SYE7 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NHSL1Q5SYE7 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NHSL1Q5SYE7 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NHSL1Q5SYE7 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NHSL1Q5SYE7 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NHSL1Q5SYE7 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NHSL1Q5SYE7 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NHSL1Q5SYE7 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NHSL1Q5SYE7 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NHSL1Q5SYE7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NHSL1Q5SYE7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NHSL1Q5SYE7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
NHSL1Q5SYE7 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
NHSL1Q5SYE7 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NHSL1Q5SYE7 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NHSL1Q5SYE7 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
NHSL1Q5SYE7 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NHSL1Q5SYE7 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NHSL1Q5SYE7 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NHSL1Q5SYE7 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NHSL1Q5SYE7 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NHSL1Q5SYE7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NHSL1Q5SYE7 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NHSL1Q5SYE7 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
NHSL1Q5SYE7 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NHSL1Q5SYE7 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
NHSL1Q5SYE7 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
NHSL1Q5SYE7 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NHSL1Q5SYE7 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NHSL1Q5SYE7 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NHSL1Q5SYE7 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NHSL1Q5SYE7 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NHSL1Q5SYE7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NHSL1Q5SYE7 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms