Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PERM1Q5SV97 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PERM1Q5SV97 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PERM1Q5SV97 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PERM1Q5SV97 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PERM1Q5SV97 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PERM1Q5SV97 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PERM1Q5SV97 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PERM1Q5SV97 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PERM1Q5SV97 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PERM1Q5SV97 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PERM1Q5SV97 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PERM1Q5SV97 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PERM1Q5SV97 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PERM1Q5SV97 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PERM1Q5SV97 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PERM1Q5SV97 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PERM1Q5SV97 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PERM1Q5SV97 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PERM1Q5SV97 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PERM1Q5SV97 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PERM1Q5SV97 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PERM1Q5SV97 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PERM1Q5SV97 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PERM1Q5SV97 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PERM1Q5SV97 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PERM1Q5SV97 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PERM1Q5SV97 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PERM1Q5SV97 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PERM1Q5SV97 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PERM1Q5SV97 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PERM1Q5SV97 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PERM1Q5SV97 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PERM1Q5SV97 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PERM1Q5SV97 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PERM1Q5SV97 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PERM1Q5SV97 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PERM1Q5SV97 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PERM1Q5SV97 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PERM1Q5SV97 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PERM1Q5SV97 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PERM1Q5SV97 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PERM1Q5SV97 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PERM1Q5SV97 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PERM1Q5SV97 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PERM1Q5SV97 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PERM1Q5SV97 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PERM1Q5SV97 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PERM1Q5SV97 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PERM1Q5SV97 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PERM1Q5SV97 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PERM1Q5SV97 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PERM1Q5SV97 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PERM1Q5SV97 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PERM1Q5SV97 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PERM1Q5SV97 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PERM1Q5SV97 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PERM1Q5SV97 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PERM1Q5SV97 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PERM1Q5SV97 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PERM1Q5SV97 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PERM1Q5SV97 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PERM1Q5SV97 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PERM1Q5SV97 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PERM1Q5SV97 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PERM1Q5SV97 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PERM1Q5SV97 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PERM1Q5SV97 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PERM1Q5SV97 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PERM1Q5SV97 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PERM1Q5SV97 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PERM1Q5SV97 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PERM1Q5SV97 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PERM1Q5SV97 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PERM1Q5SV97 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PERM1Q5SV97 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PERM1Q5SV97 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PERM1Q5SV97 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PERM1Q5SV97 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PERM1Q5SV97 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PERM1Q5SV97 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PERM1Q5SV97 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PERM1Q5SV97 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PERM1Q5SV97 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PERM1Q5SV97 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PERM1Q5SV97 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PERM1Q5SV97 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PERM1Q5SV97 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PERM1Q5SV97 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PERM1Q5SV97 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PERM1Q5SV97 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PERM1Q5SV97 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PERM1Q5SV97 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PERM1Q5SV97 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PERM1Q5SV97 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PERM1Q5SV97 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PERM1Q5SV97 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PERM1Q5SV97 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PERM1Q5SV97 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PERM1Q5SV97 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.4 ms