Protein–RNA interactions for Protein: Q59H18

TNNI3K, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3KQ59H18 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNNI3KQ59H18 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNNI3KQ59H18 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNNI3KQ59H18 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNNI3KQ59H18 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNNI3KQ59H18 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNNI3KQ59H18 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNNI3KQ59H18 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TNNI3KQ59H18 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TNNI3KQ59H18 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNNI3KQ59H18 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNNI3KQ59H18 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNNI3KQ59H18 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNNI3KQ59H18 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNNI3KQ59H18 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNNI3KQ59H18 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNNI3KQ59H18 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNNI3KQ59H18 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNNI3KQ59H18 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNNI3KQ59H18 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNNI3KQ59H18 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNNI3KQ59H18 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNNI3KQ59H18 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNNI3KQ59H18 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNNI3KQ59H18 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNNI3KQ59H18 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNNI3KQ59H18 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TNNI3KQ59H18 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TNNI3KQ59H18 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TNNI3KQ59H18 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TNNI3KQ59H18 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TNNI3KQ59H18 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNNI3KQ59H18 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TNNI3KQ59H18 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNNI3KQ59H18 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNNI3KQ59H18 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNNI3KQ59H18 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TNNI3KQ59H18 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNNI3KQ59H18 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNNI3KQ59H18 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNNI3KQ59H18 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNNI3KQ59H18 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNNI3KQ59H18 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNNI3KQ59H18 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNNI3KQ59H18 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNNI3KQ59H18 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNNI3KQ59H18 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNNI3KQ59H18 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNNI3KQ59H18 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNNI3KQ59H18 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNNI3KQ59H18 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TNNI3KQ59H18 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNNI3KQ59H18 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNNI3KQ59H18 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TNNI3KQ59H18 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNNI3KQ59H18 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNNI3KQ59H18 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNNI3KQ59H18 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNNI3KQ59H18 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNNI3KQ59H18 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNNI3KQ59H18 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNNI3KQ59H18 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNNI3KQ59H18 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNNI3KQ59H18 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNNI3KQ59H18 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNNI3KQ59H18 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNNI3KQ59H18 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNNI3KQ59H18 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNNI3KQ59H18 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNNI3KQ59H18 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNNI3KQ59H18 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNNI3KQ59H18 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TNNI3KQ59H18 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNNI3KQ59H18 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNNI3KQ59H18 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNNI3KQ59H18 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TNNI3KQ59H18 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNNI3KQ59H18 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNNI3KQ59H18 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNNI3KQ59H18 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNNI3KQ59H18 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNNI3KQ59H18 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNNI3KQ59H18 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNNI3KQ59H18 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNNI3KQ59H18 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNNI3KQ59H18 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNNI3KQ59H18 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNNI3KQ59H18 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNNI3KQ59H18 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNNI3KQ59H18 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNNI3KQ59H18 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNNI3KQ59H18 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TNNI3KQ59H18 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNNI3KQ59H18 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNNI3KQ59H18 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNNI3KQ59H18 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TNNI3KQ59H18 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNNI3KQ59H18 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNNI3KQ59H18 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNNI3KQ59H18 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms