Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
EDRF1Q3B7T1 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EDRF1Q3B7T1 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EDRF1Q3B7T1 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EDRF1Q3B7T1 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EDRF1Q3B7T1 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EDRF1Q3B7T1 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EDRF1Q3B7T1 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EDRF1Q3B7T1 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EDRF1Q3B7T1 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EDRF1Q3B7T1 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EDRF1Q3B7T1 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EDRF1Q3B7T1 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EDRF1Q3B7T1 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
EDRF1Q3B7T1 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EDRF1Q3B7T1 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EDRF1Q3B7T1 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EDRF1Q3B7T1 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EDRF1Q3B7T1 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EDRF1Q3B7T1 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EDRF1Q3B7T1 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EDRF1Q3B7T1 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EDRF1Q3B7T1 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
EDRF1Q3B7T1 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EDRF1Q3B7T1 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EDRF1Q3B7T1 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EDRF1Q3B7T1 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EDRF1Q3B7T1 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EDRF1Q3B7T1 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EDRF1Q3B7T1 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EDRF1Q3B7T1 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EDRF1Q3B7T1 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EDRF1Q3B7T1 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EDRF1Q3B7T1 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EDRF1Q3B7T1 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EDRF1Q3B7T1 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EDRF1Q3B7T1 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EDRF1Q3B7T1 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EDRF1Q3B7T1 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EDRF1Q3B7T1 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EDRF1Q3B7T1 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EDRF1Q3B7T1 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EDRF1Q3B7T1 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EDRF1Q3B7T1 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EDRF1Q3B7T1 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EDRF1Q3B7T1 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
EDRF1Q3B7T1 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EDRF1Q3B7T1 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EDRF1Q3B7T1 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EDRF1Q3B7T1 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EDRF1Q3B7T1 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EDRF1Q3B7T1 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EDRF1Q3B7T1 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EDRF1Q3B7T1 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EDRF1Q3B7T1 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EDRF1Q3B7T1 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EDRF1Q3B7T1 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EDRF1Q3B7T1 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EDRF1Q3B7T1 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EDRF1Q3B7T1 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EDRF1Q3B7T1 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EDRF1Q3B7T1 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EDRF1Q3B7T1 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EDRF1Q3B7T1 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EDRF1Q3B7T1 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
EDRF1Q3B7T1 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EDRF1Q3B7T1 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EDRF1Q3B7T1 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EDRF1Q3B7T1 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EDRF1Q3B7T1 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EDRF1Q3B7T1 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EDRF1Q3B7T1 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EDRF1Q3B7T1 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EDRF1Q3B7T1 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EDRF1Q3B7T1 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EDRF1Q3B7T1 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EDRF1Q3B7T1 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EDRF1Q3B7T1 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EDRF1Q3B7T1 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EDRF1Q3B7T1 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EDRF1Q3B7T1 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EDRF1Q3B7T1 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EDRF1Q3B7T1 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
EDRF1Q3B7T1 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EDRF1Q3B7T1 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EDRF1Q3B7T1 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EDRF1Q3B7T1 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
EDRF1Q3B7T1 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EDRF1Q3B7T1 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
EDRF1Q3B7T1 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EDRF1Q3B7T1 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EDRF1Q3B7T1 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EDRF1Q3B7T1 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EDRF1Q3B7T1 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EDRF1Q3B7T1 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EDRF1Q3B7T1 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EDRF1Q3B7T1 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EDRF1Q3B7T1 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EDRF1Q3B7T1 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EDRF1Q3B7T1 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms