Protein–RNA interactions for Protein: Q2YD98

UVSSA, UV-stimulated scaffold protein A, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UVSSAQ2YD98 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UVSSAQ2YD98 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
UVSSAQ2YD98 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UVSSAQ2YD98 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UVSSAQ2YD98 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UVSSAQ2YD98 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UVSSAQ2YD98 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
UVSSAQ2YD98 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
UVSSAQ2YD98 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UVSSAQ2YD98 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UVSSAQ2YD98 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UVSSAQ2YD98 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UVSSAQ2YD98 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UVSSAQ2YD98 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UVSSAQ2YD98 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UVSSAQ2YD98 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UVSSAQ2YD98 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UVSSAQ2YD98 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UVSSAQ2YD98 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UVSSAQ2YD98 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UVSSAQ2YD98 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UVSSAQ2YD98 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UVSSAQ2YD98 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UVSSAQ2YD98 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UVSSAQ2YD98 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UVSSAQ2YD98 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UVSSAQ2YD98 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UVSSAQ2YD98 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UVSSAQ2YD98 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UVSSAQ2YD98 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UVSSAQ2YD98 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UVSSAQ2YD98 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UVSSAQ2YD98 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UVSSAQ2YD98 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UVSSAQ2YD98 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UVSSAQ2YD98 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UVSSAQ2YD98 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UVSSAQ2YD98 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UVSSAQ2YD98 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UVSSAQ2YD98 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UVSSAQ2YD98 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UVSSAQ2YD98 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UVSSAQ2YD98 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
UVSSAQ2YD98 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UVSSAQ2YD98 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UVSSAQ2YD98 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UVSSAQ2YD98 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UVSSAQ2YD98 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UVSSAQ2YD98 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UVSSAQ2YD98 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UVSSAQ2YD98 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UVSSAQ2YD98 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UVSSAQ2YD98 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UVSSAQ2YD98 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UVSSAQ2YD98 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UVSSAQ2YD98 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UVSSAQ2YD98 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UVSSAQ2YD98 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UVSSAQ2YD98 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UVSSAQ2YD98 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UVSSAQ2YD98 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
UVSSAQ2YD98 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UVSSAQ2YD98 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UVSSAQ2YD98 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UVSSAQ2YD98 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
UVSSAQ2YD98 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UVSSAQ2YD98 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
UVSSAQ2YD98 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UVSSAQ2YD98 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UVSSAQ2YD98 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UVSSAQ2YD98 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UVSSAQ2YD98 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UVSSAQ2YD98 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UVSSAQ2YD98 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UVSSAQ2YD98 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UVSSAQ2YD98 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UVSSAQ2YD98 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UVSSAQ2YD98 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
UVSSAQ2YD98 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UVSSAQ2YD98 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UVSSAQ2YD98 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UVSSAQ2YD98 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UVSSAQ2YD98 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
UVSSAQ2YD98 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UVSSAQ2YD98 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UVSSAQ2YD98 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UVSSAQ2YD98 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UVSSAQ2YD98 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UVSSAQ2YD98 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UVSSAQ2YD98 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UVSSAQ2YD98 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UVSSAQ2YD98 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UVSSAQ2YD98 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UVSSAQ2YD98 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UVSSAQ2YD98 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UVSSAQ2YD98 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UVSSAQ2YD98 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UVSSAQ2YD98 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
UVSSAQ2YD98 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UVSSAQ2YD98 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms