Protein–RNA interactions for Protein: Q2KHR3

QSER1, Glutamine and serine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
QSER1Q2KHR3 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
QSER1Q2KHR3 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
QSER1Q2KHR3 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
QSER1Q2KHR3 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
QSER1Q2KHR3 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
QSER1Q2KHR3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
QSER1Q2KHR3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
QSER1Q2KHR3 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
QSER1Q2KHR3 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
QSER1Q2KHR3 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
QSER1Q2KHR3 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
QSER1Q2KHR3 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
QSER1Q2KHR3 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
QSER1Q2KHR3 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
QSER1Q2KHR3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
QSER1Q2KHR3 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
QSER1Q2KHR3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
QSER1Q2KHR3 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
QSER1Q2KHR3 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
QSER1Q2KHR3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
QSER1Q2KHR3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
QSER1Q2KHR3 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
QSER1Q2KHR3 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
QSER1Q2KHR3 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
QSER1Q2KHR3 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
QSER1Q2KHR3 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
QSER1Q2KHR3 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
QSER1Q2KHR3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
QSER1Q2KHR3 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
QSER1Q2KHR3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
QSER1Q2KHR3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
QSER1Q2KHR3 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
QSER1Q2KHR3 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
QSER1Q2KHR3 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
QSER1Q2KHR3 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
QSER1Q2KHR3 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
QSER1Q2KHR3 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
QSER1Q2KHR3 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
QSER1Q2KHR3 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
QSER1Q2KHR3 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
QSER1Q2KHR3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
QSER1Q2KHR3 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
QSER1Q2KHR3 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
QSER1Q2KHR3 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
QSER1Q2KHR3 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
QSER1Q2KHR3 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
QSER1Q2KHR3 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
QSER1Q2KHR3 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
QSER1Q2KHR3 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
QSER1Q2KHR3 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
QSER1Q2KHR3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
QSER1Q2KHR3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
QSER1Q2KHR3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
QSER1Q2KHR3 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
QSER1Q2KHR3 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
QSER1Q2KHR3 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
QSER1Q2KHR3 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
QSER1Q2KHR3 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
QSER1Q2KHR3 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
QSER1Q2KHR3 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
QSER1Q2KHR3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
QSER1Q2KHR3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
QSER1Q2KHR3 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
QSER1Q2KHR3 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
QSER1Q2KHR3 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
QSER1Q2KHR3 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
QSER1Q2KHR3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
QSER1Q2KHR3 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
QSER1Q2KHR3 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
QSER1Q2KHR3 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
QSER1Q2KHR3 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
QSER1Q2KHR3 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
QSER1Q2KHR3 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
QSER1Q2KHR3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
QSER1Q2KHR3 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
QSER1Q2KHR3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
QSER1Q2KHR3 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
QSER1Q2KHR3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
QSER1Q2KHR3 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
QSER1Q2KHR3 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
QSER1Q2KHR3 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
QSER1Q2KHR3 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
QSER1Q2KHR3 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
QSER1Q2KHR3 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
QSER1Q2KHR3 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
QSER1Q2KHR3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
QSER1Q2KHR3 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
QSER1Q2KHR3 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
QSER1Q2KHR3 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
QSER1Q2KHR3 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
QSER1Q2KHR3 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
QSER1Q2KHR3 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
QSER1Q2KHR3 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
QSER1Q2KHR3 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
QSER1Q2KHR3 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
QSER1Q2KHR3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
QSER1Q2KHR3 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
QSER1Q2KHR3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
QSER1Q2KHR3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
QSER1Q2KHR3 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms