Protein–RNA interactions for Protein: Q16832

DDR2, Discoidin domain-containing receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR2Q16832 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DDR2Q16832 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DDR2Q16832 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DDR2Q16832 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DDR2Q16832 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DDR2Q16832 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
DDR2Q16832 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DDR2Q16832 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DDR2Q16832 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DDR2Q16832 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
DDR2Q16832 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DDR2Q16832 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DDR2Q16832 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DDR2Q16832 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
DDR2Q16832 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DDR2Q16832 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DDR2Q16832 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DDR2Q16832 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DDR2Q16832 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DDR2Q16832 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DDR2Q16832 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DDR2Q16832 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DDR2Q16832 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DDR2Q16832 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DDR2Q16832 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DDR2Q16832 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DDR2Q16832 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
DDR2Q16832 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DDR2Q16832 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
DDR2Q16832 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DDR2Q16832 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DDR2Q16832 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DDR2Q16832 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DDR2Q16832 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DDR2Q16832 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DDR2Q16832 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DDR2Q16832 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DDR2Q16832 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DDR2Q16832 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DDR2Q16832 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DDR2Q16832 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DDR2Q16832 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DDR2Q16832 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DDR2Q16832 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DDR2Q16832 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DDR2Q16832 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DDR2Q16832 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
DDR2Q16832 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DDR2Q16832 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
DDR2Q16832 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DDR2Q16832 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DDR2Q16832 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DDR2Q16832 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DDR2Q16832 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DDR2Q16832 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DDR2Q16832 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DDR2Q16832 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
DDR2Q16832 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
DDR2Q16832 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
DDR2Q16832 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
DDR2Q16832 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
DDR2Q16832 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
DDR2Q16832 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
DDR2Q16832 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
DDR2Q16832 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
DDR2Q16832 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
DDR2Q16832 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
DDR2Q16832 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DDR2Q16832 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DDR2Q16832 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DDR2Q16832 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DDR2Q16832 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DDR2Q16832 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DDR2Q16832 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DDR2Q16832 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DDR2Q16832 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DDR2Q16832 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DDR2Q16832 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DDR2Q16832 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DDR2Q16832 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DDR2Q16832 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DDR2Q16832 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DDR2Q16832 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DDR2Q16832 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DDR2Q16832 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DDR2Q16832 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
DDR2Q16832 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DDR2Q16832 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DDR2Q16832 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DDR2Q16832 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DDR2Q16832 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DDR2Q16832 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DDR2Q16832 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DDR2Q16832 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DDR2Q16832 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DDR2Q16832 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DDR2Q16832 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DDR2Q16832 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DDR2Q16832 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DDR2Q16832 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms