Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
UPP1Q16831 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms