Protein–RNA interactions for Protein: Q16828

DUSP6, Dual specificity protein phosphatase 6, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP6Q16828 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DUSP6Q16828 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DUSP6Q16828 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DUSP6Q16828 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DUSP6Q16828 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DUSP6Q16828 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DUSP6Q16828 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DUSP6Q16828 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DUSP6Q16828 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DUSP6Q16828 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DUSP6Q16828 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DUSP6Q16828 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DUSP6Q16828 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DUSP6Q16828 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DUSP6Q16828 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DUSP6Q16828 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DUSP6Q16828 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DUSP6Q16828 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
DUSP6Q16828 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DUSP6Q16828 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
DUSP6Q16828 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DUSP6Q16828 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DUSP6Q16828 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
DUSP6Q16828 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DUSP6Q16828 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DUSP6Q16828 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DUSP6Q16828 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DUSP6Q16828 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DUSP6Q16828 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DUSP6Q16828 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DUSP6Q16828 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DUSP6Q16828 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DUSP6Q16828 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DUSP6Q16828 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DUSP6Q16828 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DUSP6Q16828 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DUSP6Q16828 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DUSP6Q16828 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DUSP6Q16828 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DUSP6Q16828 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DUSP6Q16828 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DUSP6Q16828 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DUSP6Q16828 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DUSP6Q16828 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DUSP6Q16828 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DUSP6Q16828 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DUSP6Q16828 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DUSP6Q16828 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DUSP6Q16828 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DUSP6Q16828 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DUSP6Q16828 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DUSP6Q16828 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DUSP6Q16828 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DUSP6Q16828 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
DUSP6Q16828 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DUSP6Q16828 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DUSP6Q16828 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
DUSP6Q16828 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DUSP6Q16828 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DUSP6Q16828 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DUSP6Q16828 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DUSP6Q16828 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DUSP6Q16828 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DUSP6Q16828 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DUSP6Q16828 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DUSP6Q16828 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DUSP6Q16828 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DUSP6Q16828 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DUSP6Q16828 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DUSP6Q16828 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DUSP6Q16828 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
DUSP6Q16828 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DUSP6Q16828 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DUSP6Q16828 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DUSP6Q16828 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DUSP6Q16828 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DUSP6Q16828 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DUSP6Q16828 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DUSP6Q16828 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DUSP6Q16828 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DUSP6Q16828 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DUSP6Q16828 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DUSP6Q16828 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DUSP6Q16828 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DUSP6Q16828 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DUSP6Q16828 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DUSP6Q16828 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DUSP6Q16828 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DUSP6Q16828 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DUSP6Q16828 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DUSP6Q16828 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DUSP6Q16828 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DUSP6Q16828 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DUSP6Q16828 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DUSP6Q16828 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DUSP6Q16828 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DUSP6Q16828 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DUSP6Q16828 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DUSP6Q16828 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DUSP6Q16828 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms