Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NTRK2Q16620 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms