Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIK5Q16478 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIK5Q16478 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIK5Q16478 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIK5Q16478 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIK5Q16478 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIK5Q16478 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIK5Q16478 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIK5Q16478 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIK5Q16478 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIK5Q16478 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIK5Q16478 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIK5Q16478 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIK5Q16478 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIK5Q16478 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIK5Q16478 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIK5Q16478 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIK5Q16478 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIK5Q16478 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIK5Q16478 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIK5Q16478 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIK5Q16478 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIK5Q16478 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIK5Q16478 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIK5Q16478 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIK5Q16478 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIK5Q16478 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIK5Q16478 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIK5Q16478 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIK5Q16478 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIK5Q16478 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIK5Q16478 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIK5Q16478 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIK5Q16478 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIK5Q16478 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIK5Q16478 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIK5Q16478 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIK5Q16478 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIK5Q16478 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIK5Q16478 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIK5Q16478 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIK5Q16478 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIK5Q16478 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIK5Q16478 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIK5Q16478 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIK5Q16478 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIK5Q16478 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIK5Q16478 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIK5Q16478 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIK5Q16478 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIK5Q16478 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIK5Q16478 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIK5Q16478 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIK5Q16478 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIK5Q16478 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIK5Q16478 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIK5Q16478 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIK5Q16478 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIK5Q16478 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIK5Q16478 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIK5Q16478 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIK5Q16478 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIK5Q16478 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIK5Q16478 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIK5Q16478 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIK5Q16478 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIK5Q16478 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIK5Q16478 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIK5Q16478 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIK5Q16478 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIK5Q16478 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIK5Q16478 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIK5Q16478 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIK5Q16478 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIK5Q16478 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIK5Q16478 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIK5Q16478 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GRIK5Q16478 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GRIK5Q16478 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GRIK5Q16478 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GRIK5Q16478 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GRIK5Q16478 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GRIK5Q16478 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GRIK5Q16478 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GRIK5Q16478 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GRIK5Q16478 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
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