Protein–RNA interactions for Protein: Q15768

EFNB3, Ephrin-B3, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB3Q15768 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNB3Q15768 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNB3Q15768 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNB3Q15768 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNB3Q15768 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNB3Q15768 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNB3Q15768 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNB3Q15768 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNB3Q15768 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNB3Q15768 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNB3Q15768 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNB3Q15768 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNB3Q15768 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNB3Q15768 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNB3Q15768 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNB3Q15768 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNB3Q15768 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNB3Q15768 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNB3Q15768 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNB3Q15768 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNB3Q15768 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNB3Q15768 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNB3Q15768 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNB3Q15768 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNB3Q15768 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNB3Q15768 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNB3Q15768 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNB3Q15768 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNB3Q15768 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNB3Q15768 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNB3Q15768 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNB3Q15768 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNB3Q15768 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNB3Q15768 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNB3Q15768 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNB3Q15768 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNB3Q15768 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNB3Q15768 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNB3Q15768 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNB3Q15768 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNB3Q15768 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNB3Q15768 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNB3Q15768 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNB3Q15768 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNB3Q15768 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNB3Q15768 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNB3Q15768 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNB3Q15768 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNB3Q15768 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNB3Q15768 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNB3Q15768 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNB3Q15768 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNB3Q15768 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNB3Q15768 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNB3Q15768 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNB3Q15768 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNB3Q15768 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNB3Q15768 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNB3Q15768 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNB3Q15768 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNB3Q15768 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNB3Q15768 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNB3Q15768 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNB3Q15768 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNB3Q15768 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNB3Q15768 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNB3Q15768 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNB3Q15768 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNB3Q15768 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNB3Q15768 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNB3Q15768 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNB3Q15768 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNB3Q15768 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNB3Q15768 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNB3Q15768 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNB3Q15768 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNB3Q15768 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNB3Q15768 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNB3Q15768 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNB3Q15768 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNB3Q15768 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNB3Q15768 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNB3Q15768 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNB3Q15768 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNB3Q15768 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNB3Q15768 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNB3Q15768 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNB3Q15768 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNB3Q15768 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNB3Q15768 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNB3Q15768 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNB3Q15768 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNB3Q15768 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNB3Q15768 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNB3Q15768 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNB3Q15768 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNB3Q15768 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNB3Q15768 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNB3Q15768 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNB3Q15768 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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