Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PTPRKQ15262 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PTPRKQ15262 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PTPRKQ15262 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PTPRKQ15262 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PTPRKQ15262 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PTPRKQ15262 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PTPRKQ15262 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PTPRKQ15262 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTPRKQ15262 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTPRKQ15262 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTPRKQ15262 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTPRKQ15262 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTPRKQ15262 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTPRKQ15262 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTPRKQ15262 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
PTPRKQ15262 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTPRKQ15262 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTPRKQ15262 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
PTPRKQ15262 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTPRKQ15262 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTPRKQ15262 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTPRKQ15262 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTPRKQ15262 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTPRKQ15262 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTPRKQ15262 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PTPRKQ15262 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PTPRKQ15262 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PTPRKQ15262 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PTPRKQ15262 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PTPRKQ15262 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PTPRKQ15262 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PTPRKQ15262 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
PTPRKQ15262 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PTPRKQ15262 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PTPRKQ15262 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PTPRKQ15262 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PTPRKQ15262 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PTPRKQ15262 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PTPRKQ15262 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PTPRKQ15262 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PTPRKQ15262 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
PTPRKQ15262 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
PTPRKQ15262 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PTPRKQ15262 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PTPRKQ15262 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PTPRKQ15262 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PTPRKQ15262 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PTPRKQ15262 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PTPRKQ15262 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PTPRKQ15262 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PTPRKQ15262 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PTPRKQ15262 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PTPRKQ15262 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PTPRKQ15262 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PTPRKQ15262 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PTPRKQ15262 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PTPRKQ15262 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PTPRKQ15262 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PTPRKQ15262 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PTPRKQ15262 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PTPRKQ15262 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PTPRKQ15262 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
PTPRKQ15262 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
PTPRKQ15262 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
PTPRKQ15262 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
PTPRKQ15262 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PTPRKQ15262 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PTPRKQ15262 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PTPRKQ15262 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PTPRKQ15262 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PTPRKQ15262 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PTPRKQ15262 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PTPRKQ15262 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PTPRKQ15262 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PTPRKQ15262 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PTPRKQ15262 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PTPRKQ15262 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PTPRKQ15262 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PTPRKQ15262 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PTPRKQ15262 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PTPRKQ15262 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PTPRKQ15262 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
PTPRKQ15262 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PTPRKQ15262 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PTPRKQ15262 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PTPRKQ15262 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PTPRKQ15262 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PTPRKQ15262 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PTPRKQ15262 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PTPRKQ15262 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PTPRKQ15262 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PTPRKQ15262 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
PTPRKQ15262 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PTPRKQ15262 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PTPRKQ15262 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PTPRKQ15262 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PTPRKQ15262 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPRKQ15262 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPRKQ15262 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
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