Protein–RNA interactions for Protein: Q15025

TNIP1, TNFAIP3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP1Q15025 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TNIP1Q15025 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNIP1Q15025 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNIP1Q15025 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNIP1Q15025 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNIP1Q15025 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNIP1Q15025 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNIP1Q15025 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNIP1Q15025 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNIP1Q15025 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNIP1Q15025 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNIP1Q15025 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNIP1Q15025 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNIP1Q15025 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TNIP1Q15025 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TNIP1Q15025 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TNIP1Q15025 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TNIP1Q15025 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TNIP1Q15025 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TNIP1Q15025 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNIP1Q15025 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNIP1Q15025 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNIP1Q15025 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNIP1Q15025 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNIP1Q15025 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNIP1Q15025 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNIP1Q15025 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNIP1Q15025 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNIP1Q15025 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNIP1Q15025 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNIP1Q15025 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNIP1Q15025 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNIP1Q15025 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNIP1Q15025 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNIP1Q15025 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNIP1Q15025 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNIP1Q15025 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNIP1Q15025 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNIP1Q15025 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNIP1Q15025 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNIP1Q15025 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNIP1Q15025 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNIP1Q15025 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNIP1Q15025 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNIP1Q15025 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNIP1Q15025 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNIP1Q15025 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNIP1Q15025 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNIP1Q15025 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNIP1Q15025 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNIP1Q15025 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNIP1Q15025 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNIP1Q15025 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNIP1Q15025 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNIP1Q15025 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNIP1Q15025 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNIP1Q15025 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TNIP1Q15025 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNIP1Q15025 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNIP1Q15025 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNIP1Q15025 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNIP1Q15025 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNIP1Q15025 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNIP1Q15025 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNIP1Q15025 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNIP1Q15025 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNIP1Q15025 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNIP1Q15025 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNIP1Q15025 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNIP1Q15025 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNIP1Q15025 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNIP1Q15025 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TNIP1Q15025 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNIP1Q15025 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNIP1Q15025 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNIP1Q15025 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNIP1Q15025 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNIP1Q15025 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNIP1Q15025 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNIP1Q15025 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNIP1Q15025 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNIP1Q15025 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNIP1Q15025 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNIP1Q15025 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNIP1Q15025 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNIP1Q15025 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNIP1Q15025 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNIP1Q15025 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNIP1Q15025 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNIP1Q15025 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNIP1Q15025 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNIP1Q15025 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNIP1Q15025 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNIP1Q15025 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNIP1Q15025 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNIP1Q15025 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNIP1Q15025 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNIP1Q15025 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNIP1Q15025 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNIP1Q15025 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms