Protein–RNA interactions for Protein: Q14003

KCNC3, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 3, humanhuman

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Length 757 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC3Q14003 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNC3Q14003 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNC3Q14003 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNC3Q14003 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNC3Q14003 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNC3Q14003 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNC3Q14003 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNC3Q14003 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNC3Q14003 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNC3Q14003 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNC3Q14003 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNC3Q14003 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNC3Q14003 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNC3Q14003 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNC3Q14003 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNC3Q14003 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNC3Q14003 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNC3Q14003 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNC3Q14003 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNC3Q14003 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNC3Q14003 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNC3Q14003 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNC3Q14003 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNC3Q14003 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNC3Q14003 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNC3Q14003 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNC3Q14003 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNC3Q14003 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNC3Q14003 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNC3Q14003 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNC3Q14003 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNC3Q14003 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNC3Q14003 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNC3Q14003 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNC3Q14003 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNC3Q14003 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNC3Q14003 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNC3Q14003 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNC3Q14003 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNC3Q14003 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
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KCNC3Q14003 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNC3Q14003 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNC3Q14003 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNC3Q14003 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNC3Q14003 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNC3Q14003 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
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KCNC3Q14003 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNC3Q14003 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNC3Q14003 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNC3Q14003 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNC3Q14003 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNC3Q14003 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNC3Q14003 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNC3Q14003 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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KCNC3Q14003 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
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KCNC3Q14003 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
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KCNC3Q14003 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
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KCNC3Q14003 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
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KCNC3Q14003 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNC3Q14003 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNC3Q14003 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNC3Q14003 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNC3Q14003 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNC3Q14003 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNC3Q14003 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNC3Q14003 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNC3Q14003 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNC3Q14003 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNC3Q14003 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNC3Q14003 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNC3Q14003 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNC3Q14003 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNC3Q14003 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNC3Q14003 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNC3Q14003 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNC3Q14003 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNC3Q14003 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNC3Q14003 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNC3Q14003 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNC3Q14003 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNC3Q14003 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
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