Protein–RNA interactions for Protein: Q13946

PDE7A, High affinity cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7A, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7AQ13946 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE7AQ13946 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
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