Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CCINQ13939 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CCINQ13939 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCINQ13939 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CCINQ13939 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCINQ13939 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CCINQ13939 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCINQ13939 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CCINQ13939 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCINQ13939 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCINQ13939 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCINQ13939 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCINQ13939 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCINQ13939 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCINQ13939 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCINQ13939 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCINQ13939 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCINQ13939 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCINQ13939 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCINQ13939 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCINQ13939 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CCINQ13939 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCINQ13939 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCINQ13939 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCINQ13939 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCINQ13939 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCINQ13939 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCINQ13939 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCINQ13939 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCINQ13939 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCINQ13939 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCINQ13939 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCINQ13939 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCINQ13939 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCINQ13939 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCINQ13939 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCINQ13939 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CCINQ13939 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCINQ13939 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCINQ13939 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCINQ13939 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCINQ13939 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCINQ13939 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCINQ13939 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCINQ13939 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCINQ13939 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CCINQ13939 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCINQ13939 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCINQ13939 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCINQ13939 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCINQ13939 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCINQ13939 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CCINQ13939 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCINQ13939 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCINQ13939 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCINQ13939 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCINQ13939 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCINQ13939 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCINQ13939 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCINQ13939 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCINQ13939 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CCINQ13939 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCINQ13939 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CCINQ13939 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CCINQ13939 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCINQ13939 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCINQ13939 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCINQ13939 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCINQ13939 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCINQ13939 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCINQ13939 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCINQ13939 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCINQ13939 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCINQ13939 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCINQ13939 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCINQ13939 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCINQ13939 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCINQ13939 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCINQ13939 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCINQ13939 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCINQ13939 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCINQ13939 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCINQ13939 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCINQ13939 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCINQ13939 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCINQ13939 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCINQ13939 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCINQ13939 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCINQ13939 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCINQ13939 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCINQ13939 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCINQ13939 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCINQ13939 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCINQ13939 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCINQ13939 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCINQ13939 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCINQ13939 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCINQ13939 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCINQ13939 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCINQ13939 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
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