Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SHROOM2Q13796 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
SHROOM2Q13796 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SHROOM2Q13796 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
SHROOM2Q13796 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SHROOM2Q13796 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SHROOM2Q13796 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SHROOM2Q13796 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
SHROOM2Q13796 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
SHROOM2Q13796 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
SHROOM2Q13796 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SHROOM2Q13796 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
SHROOM2Q13796 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SHROOM2Q13796 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
SHROOM2Q13796 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
SHROOM2Q13796 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SHROOM2Q13796 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SHROOM2Q13796 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SHROOM2Q13796 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SHROOM2Q13796 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SHROOM2Q13796 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
SHROOM2Q13796 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
SHROOM2Q13796 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
SHROOM2Q13796 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
SHROOM2Q13796 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
SHROOM2Q13796 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SHROOM2Q13796 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SHROOM2Q13796 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SHROOM2Q13796 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SHROOM2Q13796 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
SHROOM2Q13796 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.53
SHROOM2Q13796 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
SHROOM2Q13796 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
SHROOM2Q13796 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC30.82■■■□□ 2.52
SHROOM2Q13796 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
SHROOM2Q13796 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
SHROOM2Q13796 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
SHROOM2Q13796 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC30.82■■■□□ 2.52
SHROOM2Q13796 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
SHROOM2Q13796 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
SHROOM2Q13796 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
SHROOM2Q13796 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
SHROOM2Q13796 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
SHROOM2Q13796 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
SHROOM2Q13796 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
SHROOM2Q13796 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
SHROOM2Q13796 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
SHROOM2Q13796 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
SHROOM2Q13796 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
SHROOM2Q13796 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
SHROOM2Q13796 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC30.81■■■□□ 2.52
SHROOM2Q13796 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
SHROOM2Q13796 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
SHROOM2Q13796 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
SHROOM2Q13796 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
SHROOM2Q13796 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
SHROOM2Q13796 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
SHROOM2Q13796 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
SHROOM2Q13796 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
SHROOM2Q13796 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
SHROOM2Q13796 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
SHROOM2Q13796 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
SHROOM2Q13796 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC30.8■■■□□ 2.52
SHROOM2Q13796 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
SHROOM2Q13796 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
SHROOM2Q13796 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
SHROOM2Q13796 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
SHROOM2Q13796 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
SHROOM2Q13796 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
SHROOM2Q13796 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
SHROOM2Q13796 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
SHROOM2Q13796 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
SHROOM2Q13796 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
SHROOM2Q13796 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
SHROOM2Q13796 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
SHROOM2Q13796 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
SHROOM2Q13796 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
SHROOM2Q13796 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SHROOM2Q13796 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SHROOM2Q13796 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SHROOM2Q13796 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
SHROOM2Q13796 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
SHROOM2Q13796 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
SHROOM2Q13796 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SHROOM2Q13796 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
SHROOM2Q13796 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
SHROOM2Q13796 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
SHROOM2Q13796 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
SHROOM2Q13796 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
SHROOM2Q13796 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
SHROOM2Q13796 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
SHROOM2Q13796 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
SHROOM2Q13796 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
SHROOM2Q13796 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
SHROOM2Q13796 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
SHROOM2Q13796 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
SHROOM2Q13796 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
SHROOM2Q13796 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
SHROOM2Q13796 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
SHROOM2Q13796 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
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