Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SF3B2Q13435 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SF3B2Q13435 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SF3B2Q13435 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SF3B2Q13435 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SF3B2Q13435 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SF3B2Q13435 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SF3B2Q13435 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SF3B2Q13435 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SF3B2Q13435 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SF3B2Q13435 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SF3B2Q13435 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SF3B2Q13435 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SF3B2Q13435 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SF3B2Q13435 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SF3B2Q13435 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SF3B2Q13435 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SF3B2Q13435 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SF3B2Q13435 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SF3B2Q13435 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SF3B2Q13435 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SF3B2Q13435 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SF3B2Q13435 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SF3B2Q13435 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SF3B2Q13435 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SF3B2Q13435 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SF3B2Q13435 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SF3B2Q13435 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SF3B2Q13435 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SF3B2Q13435 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SF3B2Q13435 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SF3B2Q13435 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SF3B2Q13435 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SF3B2Q13435 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SF3B2Q13435 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SF3B2Q13435 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SF3B2Q13435 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SF3B2Q13435 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SF3B2Q13435 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SF3B2Q13435 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SF3B2Q13435 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SF3B2Q13435 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SF3B2Q13435 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SF3B2Q13435 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SF3B2Q13435 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SF3B2Q13435 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SF3B2Q13435 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SF3B2Q13435 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SF3B2Q13435 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SF3B2Q13435 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SF3B2Q13435 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SF3B2Q13435 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SF3B2Q13435 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SF3B2Q13435 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SF3B2Q13435 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SF3B2Q13435 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SF3B2Q13435 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SF3B2Q13435 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SF3B2Q13435 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SF3B2Q13435 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SF3B2Q13435 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SF3B2Q13435 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SF3B2Q13435 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SF3B2Q13435 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SF3B2Q13435 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SF3B2Q13435 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SF3B2Q13435 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SF3B2Q13435 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SF3B2Q13435 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SF3B2Q13435 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SF3B2Q13435 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SF3B2Q13435 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SF3B2Q13435 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SF3B2Q13435 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SF3B2Q13435 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SF3B2Q13435 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SF3B2Q13435 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SF3B2Q13435 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SF3B2Q13435 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SF3B2Q13435 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SF3B2Q13435 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SF3B2Q13435 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SF3B2Q13435 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SF3B2Q13435 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SF3B2Q13435 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SF3B2Q13435 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SF3B2Q13435 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SF3B2Q13435 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SF3B2Q13435 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SF3B2Q13435 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SF3B2Q13435 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SF3B2Q13435 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SF3B2Q13435 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SF3B2Q13435 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SF3B2Q13435 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SF3B2Q13435 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SF3B2Q13435 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SF3B2Q13435 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SF3B2Q13435 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SF3B2Q13435 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
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