Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATMQ13315 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATMQ13315 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATMQ13315 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATMQ13315 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ATMQ13315 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATMQ13315 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATMQ13315 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATMQ13315 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATMQ13315 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ATMQ13315 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATMQ13315 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATMQ13315 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATMQ13315 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATMQ13315 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATMQ13315 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATMQ13315 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATMQ13315 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATMQ13315 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATMQ13315 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATMQ13315 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATMQ13315 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATMQ13315 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATMQ13315 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ATMQ13315 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATMQ13315 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ATMQ13315 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATMQ13315 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ATMQ13315 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ATMQ13315 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ATMQ13315 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATMQ13315 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATMQ13315 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATMQ13315 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATMQ13315 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATMQ13315 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATMQ13315 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ATMQ13315 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATMQ13315 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ATMQ13315 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATMQ13315 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATMQ13315 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATMQ13315 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATMQ13315 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATMQ13315 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATMQ13315 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATMQ13315 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATMQ13315 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ATMQ13315 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ATMQ13315 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATMQ13315 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATMQ13315 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATMQ13315 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATMQ13315 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATMQ13315 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATMQ13315 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATMQ13315 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATMQ13315 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATMQ13315 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATMQ13315 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATMQ13315 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATMQ13315 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATMQ13315 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATMQ13315 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATMQ13315 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATMQ13315 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATMQ13315 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATMQ13315 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATMQ13315 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATMQ13315 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATMQ13315 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATMQ13315 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATMQ13315 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATMQ13315 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATMQ13315 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATMQ13315 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
ATMQ13315 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
ATMQ13315 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATMQ13315 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATMQ13315 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATMQ13315 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATMQ13315 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATMQ13315 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATMQ13315 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATMQ13315 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATMQ13315 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATMQ13315 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATMQ13315 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATMQ13315 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATMQ13315 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATMQ13315 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ATMQ13315 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATMQ13315 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATMQ13315 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATMQ13315 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATMQ13315 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATMQ13315 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATMQ13315 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATMQ13315 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATMQ13315 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
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