Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DUSP4Q13115 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DUSP4Q13115 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
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