Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
FOXF2Q12947 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
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