Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
BPTFQ12830 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
BPTFQ12830 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
BPTFQ12830 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
BPTFQ12830 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
BPTFQ12830 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
BPTFQ12830 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
BPTFQ12830 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
BPTFQ12830 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
BPTFQ12830 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
BPTFQ12830 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
BPTFQ12830 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
BPTFQ12830 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
BPTFQ12830 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
BPTFQ12830 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
BPTFQ12830 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
BPTFQ12830 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
BPTFQ12830 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
BPTFQ12830 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
BPTFQ12830 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
BPTFQ12830 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
BPTFQ12830 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
BPTFQ12830 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
BPTFQ12830 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
BPTFQ12830 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
BPTFQ12830 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
BPTFQ12830 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
BPTFQ12830 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
BPTFQ12830 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
BPTFQ12830 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
BPTFQ12830 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
BPTFQ12830 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
BPTFQ12830 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
BPTFQ12830 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
BPTFQ12830 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
BPTFQ12830 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
BPTFQ12830 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
BPTFQ12830 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
BPTFQ12830 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
BPTFQ12830 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
BPTFQ12830 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
BPTFQ12830 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
BPTFQ12830 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
BPTFQ12830 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
BPTFQ12830 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
BPTFQ12830 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
BPTFQ12830 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
BPTFQ12830 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
BPTFQ12830 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
BPTFQ12830 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
BPTFQ12830 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
BPTFQ12830 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
BPTFQ12830 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
BPTFQ12830 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
BPTFQ12830 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
BPTFQ12830 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
BPTFQ12830 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
BPTFQ12830 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.39■□□□□ 0.7
BPTFQ12830 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
BPTFQ12830 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
BPTFQ12830 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
BPTFQ12830 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
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