Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNB2Q08289 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNB2Q08289 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNB2Q08289 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNB2Q08289 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNB2Q08289 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNB2Q08289 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNB2Q08289 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNB2Q08289 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNB2Q08289 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNB2Q08289 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNB2Q08289 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNB2Q08289 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNB2Q08289 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNB2Q08289 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNB2Q08289 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNB2Q08289 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACNB2Q08289 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNB2Q08289 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNB2Q08289 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNB2Q08289 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNB2Q08289 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNB2Q08289 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNB2Q08289 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNB2Q08289 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNB2Q08289 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNB2Q08289 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNB2Q08289 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNB2Q08289 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNB2Q08289 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNB2Q08289 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNB2Q08289 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNB2Q08289 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNB2Q08289 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNB2Q08289 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNB2Q08289 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNB2Q08289 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNB2Q08289 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNB2Q08289 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNB2Q08289 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNB2Q08289 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNB2Q08289 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNB2Q08289 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNB2Q08289 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNB2Q08289 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNB2Q08289 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNB2Q08289 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNB2Q08289 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNB2Q08289 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNB2Q08289 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNB2Q08289 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNB2Q08289 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNB2Q08289 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNB2Q08289 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNB2Q08289 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNB2Q08289 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNB2Q08289 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNB2Q08289 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNB2Q08289 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNB2Q08289 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNB2Q08289 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNB2Q08289 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNB2Q08289 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNB2Q08289 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNB2Q08289 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNB2Q08289 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNB2Q08289 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNB2Q08289 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNB2Q08289 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNB2Q08289 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNB2Q08289 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNB2Q08289 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNB2Q08289 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNB2Q08289 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNB2Q08289 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNB2Q08289 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNB2Q08289 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNB2Q08289 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNB2Q08289 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNB2Q08289 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNB2Q08289 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNB2Q08289 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNB2Q08289 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNB2Q08289 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNB2Q08289 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNB2Q08289 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNB2Q08289 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNB2Q08289 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNB2Q08289 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNB2Q08289 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNB2Q08289 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNB2Q08289 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNB2Q08289 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNB2Q08289 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNB2Q08289 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNB2Q08289 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNB2Q08289 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNB2Q08289 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNB2Q08289 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNB2Q08289 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms