Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TFF3Q07654 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms