Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PSME1Q06323 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PSME1Q06323 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PSME1Q06323 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PSME1Q06323 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PSME1Q06323 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PSME1Q06323 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PSME1Q06323 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PSME1Q06323 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PSME1Q06323 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PSME1Q06323 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PSME1Q06323 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PSME1Q06323 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PSME1Q06323 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PSME1Q06323 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PSME1Q06323 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PSME1Q06323 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PSME1Q06323 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PSME1Q06323 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PSME1Q06323 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PSME1Q06323 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PSME1Q06323 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PSME1Q06323 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PSME1Q06323 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PSME1Q06323 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PSME1Q06323 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PSME1Q06323 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PSME1Q06323 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PSME1Q06323 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PSME1Q06323 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PSME1Q06323 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PSME1Q06323 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PSME1Q06323 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PSME1Q06323 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PSME1Q06323 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PSME1Q06323 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PSME1Q06323 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PSME1Q06323 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PSME1Q06323 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PSME1Q06323 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PSME1Q06323 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PSME1Q06323 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PSME1Q06323 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PSME1Q06323 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PSME1Q06323 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PSME1Q06323 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PSME1Q06323 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PSME1Q06323 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PSME1Q06323 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PSME1Q06323 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PSME1Q06323 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PSME1Q06323 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PSME1Q06323 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PSME1Q06323 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PSME1Q06323 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PSME1Q06323 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PSME1Q06323 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PSME1Q06323 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PSME1Q06323 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PSME1Q06323 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PSME1Q06323 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PSME1Q06323 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PSME1Q06323 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
PSME1Q06323 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PSME1Q06323 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PSME1Q06323 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
PSME1Q06323 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PSME1Q06323 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PSME1Q06323 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PSME1Q06323 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PSME1Q06323 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PSME1Q06323 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PSME1Q06323 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PSME1Q06323 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PSME1Q06323 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PSME1Q06323 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PSME1Q06323 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PSME1Q06323 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PSME1Q06323 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PSME1Q06323 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PSME1Q06323 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PSME1Q06323 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PSME1Q06323 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PSME1Q06323 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PSME1Q06323 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PSME1Q06323 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PSME1Q06323 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PSME1Q06323 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PSME1Q06323 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PSME1Q06323 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PSME1Q06323 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PSME1Q06323 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PSME1Q06323 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PSME1Q06323 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PSME1Q06323 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PSME1Q06323 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PSME1Q06323 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PSME1Q06323 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PSME1Q06323 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PSME1Q06323 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms