Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IRF8Q02556 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms