Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMO4P61968 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMO4P61968 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMO4P61968 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMO4P61968 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMO4P61968 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMO4P61968 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMO4P61968 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMO4P61968 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMO4P61968 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMO4P61968 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMO4P61968 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMO4P61968 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMO4P61968 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMO4P61968 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LMO4P61968 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMO4P61968 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LMO4P61968 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LMO4P61968 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMO4P61968 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMO4P61968 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LMO4P61968 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LMO4P61968 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMO4P61968 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMO4P61968 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMO4P61968 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMO4P61968 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMO4P61968 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMO4P61968 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMO4P61968 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMO4P61968 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LMO4P61968 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMO4P61968 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMO4P61968 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMO4P61968 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMO4P61968 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMO4P61968 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMO4P61968 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LMO4P61968 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMO4P61968 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMO4P61968 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMO4P61968 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMO4P61968 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMO4P61968 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LMO4P61968 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMO4P61968 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMO4P61968 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMO4P61968 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LMO4P61968 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMO4P61968 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMO4P61968 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMO4P61968 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMO4P61968 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMO4P61968 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LMO4P61968 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LMO4P61968 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMO4P61968 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMO4P61968 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LMO4P61968 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMO4P61968 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMO4P61968 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMO4P61968 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMO4P61968 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMO4P61968 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMO4P61968 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMO4P61968 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMO4P61968 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMO4P61968 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LMO4P61968 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO4P61968 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO4P61968 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO4P61968 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO4P61968 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO4P61968 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO4P61968 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO4P61968 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO4P61968 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO4P61968 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO4P61968 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO4P61968 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO4P61968 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO4P61968 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO4P61968 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO4P61968 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO4P61968 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO4P61968 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO4P61968 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO4P61968 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO4P61968 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO4P61968 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO4P61968 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO4P61968 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO4P61968 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO4P61968 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO4P61968 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO4P61968 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO4P61968 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO4P61968 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO4P61968 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMO4P61968 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms