Protein–RNA interactions for Protein: P53396

ACLY, ATP-citrate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACLYP53396 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACLYP53396 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACLYP53396 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACLYP53396 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACLYP53396 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACLYP53396 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ACLYP53396 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACLYP53396 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACLYP53396 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACLYP53396 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACLYP53396 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACLYP53396 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACLYP53396 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACLYP53396 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACLYP53396 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACLYP53396 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACLYP53396 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACLYP53396 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACLYP53396 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACLYP53396 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACLYP53396 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACLYP53396 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACLYP53396 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACLYP53396 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACLYP53396 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACLYP53396 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACLYP53396 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACLYP53396 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACLYP53396 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACLYP53396 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACLYP53396 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACLYP53396 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACLYP53396 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACLYP53396 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACLYP53396 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACLYP53396 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACLYP53396 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACLYP53396 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACLYP53396 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACLYP53396 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACLYP53396 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACLYP53396 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACLYP53396 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACLYP53396 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACLYP53396 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ACLYP53396 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ACLYP53396 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACLYP53396 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ACLYP53396 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACLYP53396 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ACLYP53396 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACLYP53396 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACLYP53396 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACLYP53396 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACLYP53396 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACLYP53396 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACLYP53396 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACLYP53396 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACLYP53396 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACLYP53396 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACLYP53396 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACLYP53396 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACLYP53396 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACLYP53396 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACLYP53396 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACLYP53396 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACLYP53396 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACLYP53396 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACLYP53396 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACLYP53396 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACLYP53396 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ACLYP53396 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ACLYP53396 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ACLYP53396 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ACLYP53396 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ACLYP53396 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ACLYP53396 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ACLYP53396 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACLYP53396 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACLYP53396 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACLYP53396 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACLYP53396 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACLYP53396 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACLYP53396 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACLYP53396 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ACLYP53396 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACLYP53396 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ACLYP53396 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACLYP53396 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACLYP53396 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ACLYP53396 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ACLYP53396 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACLYP53396 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ACLYP53396 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACLYP53396 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ACLYP53396 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ACLYP53396 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACLYP53396 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ACLYP53396 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ACLYP53396 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms