Protein–RNA interactions for Protein: P43304

GPD2, Glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPD2P43304 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GPD2P43304 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GPD2P43304 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GPD2P43304 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GPD2P43304 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GPD2P43304 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GPD2P43304 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GPD2P43304 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GPD2P43304 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPD2P43304 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPD2P43304 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPD2P43304 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPD2P43304 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPD2P43304 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPD2P43304 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPD2P43304 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPD2P43304 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPD2P43304 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPD2P43304 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GPD2P43304 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GPD2P43304 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPD2P43304 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GPD2P43304 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPD2P43304 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPD2P43304 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPD2P43304 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPD2P43304 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPD2P43304 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPD2P43304 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPD2P43304 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPD2P43304 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPD2P43304 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPD2P43304 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPD2P43304 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPD2P43304 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPD2P43304 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GPD2P43304 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPD2P43304 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPD2P43304 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPD2P43304 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPD2P43304 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPD2P43304 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPD2P43304 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPD2P43304 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPD2P43304 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPD2P43304 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPD2P43304 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPD2P43304 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPD2P43304 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GPD2P43304 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPD2P43304 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPD2P43304 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPD2P43304 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPD2P43304 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GPD2P43304 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPD2P43304 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPD2P43304 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPD2P43304 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPD2P43304 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GPD2P43304 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GPD2P43304 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GPD2P43304 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GPD2P43304 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GPD2P43304 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GPD2P43304 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GPD2P43304 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GPD2P43304 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GPD2P43304 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GPD2P43304 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GPD2P43304 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GPD2P43304 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GPD2P43304 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GPD2P43304 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GPD2P43304 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GPD2P43304 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GPD2P43304 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GPD2P43304 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GPD2P43304 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GPD2P43304 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GPD2P43304 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GPD2P43304 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GPD2P43304 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GPD2P43304 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPD2P43304 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPD2P43304 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GPD2P43304 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPD2P43304 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPD2P43304 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPD2P43304 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPD2P43304 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPD2P43304 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPD2P43304 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPD2P43304 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPD2P43304 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPD2P43304 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPD2P43304 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPD2P43304 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPD2P43304 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPD2P43304 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPD2P43304 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms