Protein–RNA interactions for Protein: P41229

KDM5C, Lysine-specific demethylase 5C, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5CP41229 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
KDM5CP41229 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
KDM5CP41229 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
KDM5CP41229 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
KDM5CP41229 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
KDM5CP41229 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
KDM5CP41229 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
KDM5CP41229 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
KDM5CP41229 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
KDM5CP41229 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
KDM5CP41229 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
KDM5CP41229 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
KDM5CP41229 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
KDM5CP41229 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
KDM5CP41229 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
KDM5CP41229 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
KDM5CP41229 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
KDM5CP41229 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
KDM5CP41229 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
KDM5CP41229 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
KDM5CP41229 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
KDM5CP41229 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
KDM5CP41229 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KDM5CP41229 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
KDM5CP41229 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
KDM5CP41229 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KDM5CP41229 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KDM5CP41229 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KDM5CP41229 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KDM5CP41229 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KDM5CP41229 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
KDM5CP41229 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KDM5CP41229 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KDM5CP41229 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
KDM5CP41229 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KDM5CP41229 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
KDM5CP41229 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KDM5CP41229 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
KDM5CP41229 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KDM5CP41229 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KDM5CP41229 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
KDM5CP41229 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
KDM5CP41229 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
KDM5CP41229 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
KDM5CP41229 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
KDM5CP41229 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
KDM5CP41229 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
KDM5CP41229 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
KDM5CP41229 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
KDM5CP41229 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
KDM5CP41229 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
KDM5CP41229 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
KDM5CP41229 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
KDM5CP41229 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
KDM5CP41229 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
KDM5CP41229 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
KDM5CP41229 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
KDM5CP41229 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
KDM5CP41229 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
KDM5CP41229 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
KDM5CP41229 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
KDM5CP41229 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
KDM5CP41229 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
KDM5CP41229 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
KDM5CP41229 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
KDM5CP41229 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
KDM5CP41229 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
KDM5CP41229 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
KDM5CP41229 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
KDM5CP41229 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
KDM5CP41229 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
KDM5CP41229 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
KDM5CP41229 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
KDM5CP41229 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
KDM5CP41229 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
KDM5CP41229 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
KDM5CP41229 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
KDM5CP41229 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
KDM5CP41229 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
KDM5CP41229 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
KDM5CP41229 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
KDM5CP41229 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
KDM5CP41229 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
KDM5CP41229 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
KDM5CP41229 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
KDM5CP41229 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
KDM5CP41229 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC29■■■□□ 2.23
KDM5CP41229 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
KDM5CP41229 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
KDM5CP41229 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
KDM5CP41229 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
KDM5CP41229 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
KDM5CP41229 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
KDM5CP41229 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC29■■■□□ 2.23
KDM5CP41229 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC29■■■□□ 2.23
KDM5CP41229 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
KDM5CP41229 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
KDM5CP41229 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
KDM5CP41229 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
KDM5CP41229 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms