Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDIT3P35638 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDIT3P35638 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDIT3P35638 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDIT3P35638 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDIT3P35638 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
DDIT3P35638 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
DDIT3P35638 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
DDIT3P35638 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDIT3P35638 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
DDIT3P35638 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDIT3P35638 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDIT3P35638 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDIT3P35638 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDIT3P35638 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDIT3P35638 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDIT3P35638 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDIT3P35638 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDIT3P35638 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDIT3P35638 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDIT3P35638 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDIT3P35638 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDIT3P35638 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDIT3P35638 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDIT3P35638 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDIT3P35638 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDIT3P35638 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDIT3P35638 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDIT3P35638 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDIT3P35638 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDIT3P35638 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDIT3P35638 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDIT3P35638 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDIT3P35638 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDIT3P35638 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDIT3P35638 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDIT3P35638 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDIT3P35638 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDIT3P35638 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDIT3P35638 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDIT3P35638 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDIT3P35638 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDIT3P35638 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDIT3P35638 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
DDIT3P35638 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDIT3P35638 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDIT3P35638 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDIT3P35638 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDIT3P35638 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDIT3P35638 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDIT3P35638 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDIT3P35638 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDIT3P35638 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDIT3P35638 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDIT3P35638 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDIT3P35638 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDIT3P35638 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
DDIT3P35638 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
DDIT3P35638 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDIT3P35638 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDIT3P35638 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDIT3P35638 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDIT3P35638 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDIT3P35638 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDIT3P35638 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDIT3P35638 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDIT3P35638 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDIT3P35638 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDIT3P35638 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDIT3P35638 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDIT3P35638 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDIT3P35638 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDIT3P35638 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDIT3P35638 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDIT3P35638 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDIT3P35638 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDIT3P35638 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDIT3P35638 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
DDIT3P35638 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDIT3P35638 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDIT3P35638 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDIT3P35638 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDIT3P35638 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDIT3P35638 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDIT3P35638 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDIT3P35638 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDIT3P35638 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDIT3P35638 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDIT3P35638 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDIT3P35638 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDIT3P35638 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDIT3P35638 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDIT3P35638 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDIT3P35638 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDIT3P35638 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDIT3P35638 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDIT3P35638 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDIT3P35638 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDIT3P35638 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDIT3P35638 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms