Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SFTPDP35247 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SFTPDP35247 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SFTPDP35247 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SFTPDP35247 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SFTPDP35247 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SFTPDP35247 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SFTPDP35247 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SFTPDP35247 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SFTPDP35247 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SFTPDP35247 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SFTPDP35247 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SFTPDP35247 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SFTPDP35247 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SFTPDP35247 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SFTPDP35247 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SFTPDP35247 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SFTPDP35247 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SFTPDP35247 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SFTPDP35247 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SFTPDP35247 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SFTPDP35247 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SFTPDP35247 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SFTPDP35247 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SFTPDP35247 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SFTPDP35247 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SFTPDP35247 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SFTPDP35247 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SFTPDP35247 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SFTPDP35247 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SFTPDP35247 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms