Protein–RNA interactions for Protein: P31941

APOBEC3A, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3AP31941 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC3AP31941 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms