Protein–RNA interactions for Protein: P29375

KDM5A, Lysine-specific demethylase 5A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5AP29375 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KDM5AP29375 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KDM5AP29375 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KDM5AP29375 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KDM5AP29375 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KDM5AP29375 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KDM5AP29375 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KDM5AP29375 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KDM5AP29375 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KDM5AP29375 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KDM5AP29375 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KDM5AP29375 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KDM5AP29375 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KDM5AP29375 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KDM5AP29375 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
KDM5AP29375 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KDM5AP29375 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KDM5AP29375 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
KDM5AP29375 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
KDM5AP29375 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
KDM5AP29375 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KDM5AP29375 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KDM5AP29375 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
KDM5AP29375 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
KDM5AP29375 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
KDM5AP29375 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
KDM5AP29375 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
KDM5AP29375 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
KDM5AP29375 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KDM5AP29375 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KDM5AP29375 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KDM5AP29375 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KDM5AP29375 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KDM5AP29375 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KDM5AP29375 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KDM5AP29375 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KDM5AP29375 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KDM5AP29375 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
KDM5AP29375 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KDM5AP29375 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KDM5AP29375 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KDM5AP29375 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KDM5AP29375 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KDM5AP29375 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KDM5AP29375 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KDM5AP29375 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KDM5AP29375 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
KDM5AP29375 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KDM5AP29375 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KDM5AP29375 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KDM5AP29375 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KDM5AP29375 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
KDM5AP29375 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KDM5AP29375 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
KDM5AP29375 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KDM5AP29375 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
KDM5AP29375 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
KDM5AP29375 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
KDM5AP29375 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KDM5AP29375 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KDM5AP29375 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
KDM5AP29375 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
KDM5AP29375 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KDM5AP29375 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
KDM5AP29375 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
KDM5AP29375 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
KDM5AP29375 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
KDM5AP29375 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
KDM5AP29375 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
KDM5AP29375 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KDM5AP29375 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KDM5AP29375 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KDM5AP29375 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KDM5AP29375 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KDM5AP29375 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KDM5AP29375 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KDM5AP29375 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KDM5AP29375 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
KDM5AP29375 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KDM5AP29375 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KDM5AP29375 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KDM5AP29375 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KDM5AP29375 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KDM5AP29375 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KDM5AP29375 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KDM5AP29375 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KDM5AP29375 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KDM5AP29375 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KDM5AP29375 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KDM5AP29375 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KDM5AP29375 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KDM5AP29375 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
KDM5AP29375 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KDM5AP29375 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KDM5AP29375 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
KDM5AP29375 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KDM5AP29375 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KDM5AP29375 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KDM5AP29375 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KDM5AP29375 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms