Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXD10P28358 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HOXD10P28358 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HOXD10P28358 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HOXD10P28358 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HOXD10P28358 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXD10P28358 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXD10P28358 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXD10P28358 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXD10P28358 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXD10P28358 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXD10P28358 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXD10P28358 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXD10P28358 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXD10P28358 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXD10P28358 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXD10P28358 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXD10P28358 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXD10P28358 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXD10P28358 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXD10P28358 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXD10P28358 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXD10P28358 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXD10P28358 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXD10P28358 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXD10P28358 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXD10P28358 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXD10P28358 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXD10P28358 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXD10P28358 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXD10P28358 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXD10P28358 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXD10P28358 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXD10P28358 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXD10P28358 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXD10P28358 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXD10P28358 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXD10P28358 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXD10P28358 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXD10P28358 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXD10P28358 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXD10P28358 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXD10P28358 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXD10P28358 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXD10P28358 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXD10P28358 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXD10P28358 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXD10P28358 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXD10P28358 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXD10P28358 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXD10P28358 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXD10P28358 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXD10P28358 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXD10P28358 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXD10P28358 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXD10P28358 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXD10P28358 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
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HOXD10P28358 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXD10P28358 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXD10P28358 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXD10P28358 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXD10P28358 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXD10P28358 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXD10P28358 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXD10P28358 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXD10P28358 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXD10P28358 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXD10P28358 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXD10P28358 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXD10P28358 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXD10P28358 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXD10P28358 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXD10P28358 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXD10P28358 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXD10P28358 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXD10P28358 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXD10P28358 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXD10P28358 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXD10P28358 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXD10P28358 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXD10P28358 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
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