Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD53P19397 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CD53P19397 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD53P19397 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD53P19397 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD53P19397 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD53P19397 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD53P19397 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CD53P19397 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD53P19397 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD53P19397 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD53P19397 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD53P19397 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD53P19397 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CD53P19397 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CD53P19397 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CD53P19397 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CD53P19397 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CD53P19397 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CD53P19397 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CD53P19397 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CD53P19397 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CD53P19397 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CD53P19397 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CD53P19397 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CD53P19397 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CD53P19397 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CD53P19397 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CD53P19397 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CD53P19397 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CD53P19397 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CD53P19397 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CD53P19397 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CD53P19397 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CD53P19397 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD53P19397 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD53P19397 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD53P19397 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD53P19397 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD53P19397 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD53P19397 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD53P19397 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD53P19397 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD53P19397 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD53P19397 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD53P19397 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD53P19397 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD53P19397 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD53P19397 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD53P19397 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD53P19397 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD53P19397 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD53P19397 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD53P19397 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD53P19397 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD53P19397 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD53P19397 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD53P19397 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD53P19397 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CD53P19397 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD53P19397 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD53P19397 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD53P19397 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD53P19397 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD53P19397 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD53P19397 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD53P19397 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD53P19397 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD53P19397 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD53P19397 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD53P19397 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD53P19397 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD53P19397 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD53P19397 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CD53P19397 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CD53P19397 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CD53P19397 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CD53P19397 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CD53P19397 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CD53P19397 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CD53P19397 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CD53P19397 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CD53P19397 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CD53P19397 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CD53P19397 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CD53P19397 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CD53P19397 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CD53P19397 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CD53P19397 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CD53P19397 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CD53P19397 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CD53P19397 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CD53P19397 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CD53P19397 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CD53P19397 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CD53P19397 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CD53P19397 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CD53P19397 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD53P19397 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD53P19397 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms