Protein–RNA interactions for Protein: P14867

GABRA1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA1P14867 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABRA1P14867 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABRA1P14867 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABRA1P14867 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABRA1P14867 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABRA1P14867 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABRA1P14867 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GABRA1P14867 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GABRA1P14867 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GABRA1P14867 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GABRA1P14867 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GABRA1P14867 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GABRA1P14867 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GABRA1P14867 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GABRA1P14867 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GABRA1P14867 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
GABRA1P14867 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms