Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GJB1P08034 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GJB1P08034 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
GJB1P08034 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GJB1P08034 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GJB1P08034 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
GJB1P08034 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GJB1P08034 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GJB1P08034 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
GJB1P08034 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GJB1P08034 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GJB1P08034 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GJB1P08034 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GJB1P08034 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
GJB1P08034 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GJB1P08034 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GJB1P08034 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GJB1P08034 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GJB1P08034 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GJB1P08034 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GJB1P08034 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GJB1P08034 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GJB1P08034 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GJB1P08034 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GJB1P08034 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GJB1P08034 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GJB1P08034 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GJB1P08034 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GJB1P08034 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GJB1P08034 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GJB1P08034 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GJB1P08034 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GJB1P08034 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GJB1P08034 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GJB1P08034 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GJB1P08034 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GJB1P08034 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
GJB1P08034 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GJB1P08034 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GJB1P08034 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GJB1P08034 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GJB1P08034 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GJB1P08034 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GJB1P08034 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GJB1P08034 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GJB1P08034 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GJB1P08034 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GJB1P08034 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GJB1P08034 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GJB1P08034 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GJB1P08034 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJB1P08034 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJB1P08034 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJB1P08034 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJB1P08034 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJB1P08034 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJB1P08034 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJB1P08034 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJB1P08034 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJB1P08034 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GJB1P08034 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJB1P08034 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJB1P08034 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJB1P08034 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJB1P08034 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJB1P08034 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJB1P08034 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJB1P08034 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJB1P08034 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJB1P08034 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJB1P08034 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJB1P08034 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJB1P08034 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJB1P08034 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJB1P08034 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJB1P08034 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJB1P08034 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJB1P08034 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJB1P08034 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJB1P08034 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJB1P08034 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJB1P08034 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJB1P08034 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GJB1P08034 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJB1P08034 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJB1P08034 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJB1P08034 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJB1P08034 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJB1P08034 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJB1P08034 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJB1P08034 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJB1P08034 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJB1P08034 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJB1P08034 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJB1P08034 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJB1P08034 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJB1P08034 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJB1P08034 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJB1P08034 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJB1P08034 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms