Protein–RNA interactions for Protein: P04818

TYMS, Thymidylate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYMSP04818 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TYMSP04818 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TYMSP04818 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TYMSP04818 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TYMSP04818 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TYMSP04818 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TYMSP04818 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TYMSP04818 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TYMSP04818 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
TYMSP04818 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TYMSP04818 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TYMSP04818 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TYMSP04818 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TYMSP04818 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TYMSP04818 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TYMSP04818 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TYMSP04818 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TYMSP04818 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TYMSP04818 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TYMSP04818 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TYMSP04818 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TYMSP04818 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TYMSP04818 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TYMSP04818 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TYMSP04818 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TYMSP04818 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TYMSP04818 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TYMSP04818 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TYMSP04818 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TYMSP04818 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TYMSP04818 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TYMSP04818 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TYMSP04818 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TYMSP04818 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TYMSP04818 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TYMSP04818 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TYMSP04818 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TYMSP04818 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TYMSP04818 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TYMSP04818 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TYMSP04818 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TYMSP04818 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TYMSP04818 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TYMSP04818 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TYMSP04818 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TYMSP04818 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TYMSP04818 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TYMSP04818 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TYMSP04818 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TYMSP04818 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TYMSP04818 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TYMSP04818 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TYMSP04818 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TYMSP04818 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TYMSP04818 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TYMSP04818 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TYMSP04818 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TYMSP04818 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
TYMSP04818 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TYMSP04818 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TYMSP04818 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TYMSP04818 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TYMSP04818 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TYMSP04818 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TYMSP04818 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TYMSP04818 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TYMSP04818 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TYMSP04818 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TYMSP04818 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TYMSP04818 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TYMSP04818 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TYMSP04818 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TYMSP04818 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TYMSP04818 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TYMSP04818 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TYMSP04818 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TYMSP04818 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TYMSP04818 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TYMSP04818 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TYMSP04818 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TYMSP04818 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TYMSP04818 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TYMSP04818 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TYMSP04818 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TYMSP04818 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TYMSP04818 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TYMSP04818 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TYMSP04818 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TYMSP04818 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TYMSP04818 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
TYMSP04818 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TYMSP04818 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TYMSP04818 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TYMSP04818 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
TYMSP04818 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TYMSP04818 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TYMSP04818 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TYMSP04818 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TYMSP04818 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TYMSP04818 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms