Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
ABCC9O60706 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.57■■■■□ 3.77
ABCC9O60706 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
ABCC9O60706 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC38.57■■■■□ 3.77
ABCC9O60706 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
ABCC9O60706 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
ABCC9O60706 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
ABCC9O60706 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
ABCC9O60706 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
ABCC9O60706 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
ABCC9O60706 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC38.57■■■■□ 3.76
ABCC9O60706 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
ABCC9O60706 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC38.56■■■■□ 3.76
ABCC9O60706 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC38.56■■■■□ 3.76
ABCC9O60706 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC38.56■■■■□ 3.76
ABCC9O60706 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
ABCC9O60706 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
ABCC9O60706 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC38.55■■■■□ 3.76
ABCC9O60706 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC38.55■■■■□ 3.76
ABCC9O60706 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC38.55■■■■□ 3.76
ABCC9O60706 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC38.55■■■■□ 3.76
ABCC9O60706 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
ABCC9O60706 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.55■■■■□ 3.76
ABCC9O60706 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
ABCC9O60706 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.55■■■■□ 3.76
ABCC9O60706 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
ABCC9O60706 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC38.54■■■■□ 3.76
ABCC9O60706 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
ABCC9O60706 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC38.54■■■■□ 3.76
ABCC9O60706 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.54■■■■□ 3.76
ABCC9O60706 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC38.54■■■■□ 3.76
ABCC9O60706 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC38.54■■■■□ 3.76
ABCC9O60706 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC38.54■■■■□ 3.76
ABCC9O60706 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
ABCC9O60706 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC38.54■■■■□ 3.76
ABCC9O60706 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
ABCC9O60706 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC38.53■■■■□ 3.76
ABCC9O60706 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
ABCC9O60706 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.53■■■■□ 3.76
ABCC9O60706 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.53■■■■□ 3.76
ABCC9O60706 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
ABCC9O60706 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC38.53■■■■□ 3.76
ABCC9O60706 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
ABCC9O60706 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC38.53■■■■□ 3.76
ABCC9O60706 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC38.53■■■■□ 3.76
ABCC9O60706 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.53■■■■□ 3.76
ABCC9O60706 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC38.53■■■■□ 3.76
ABCC9O60706 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC38.53■■■■□ 3.76
ABCC9O60706 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC38.53■■■■□ 3.76
ABCC9O60706 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC38.53■■■■□ 3.76
ABCC9O60706 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
ABCC9O60706 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
ABCC9O60706 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
ABCC9O60706 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
ABCC9O60706 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
ABCC9O60706 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
ABCC9O60706 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
ABCC9O60706 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
ABCC9O60706 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
ABCC9O60706 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC38.52■■■■□ 3.76
ABCC9O60706 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
ABCC9O60706 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC38.52■■■■□ 3.76
ABCC9O60706 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC38.52■■■■□ 3.76
ABCC9O60706 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
ABCC9O60706 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
ABCC9O60706 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC38.51■■■■□ 3.76
ABCC9O60706 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
ABCC9O60706 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
ABCC9O60706 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
ABCC9O60706 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC38.51■■■■□ 3.76
ABCC9O60706 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
ABCC9O60706 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.51■■■■□ 3.76
ABCC9O60706 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC38.51■■■■□ 3.76
ABCC9O60706 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
ABCC9O60706 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
ABCC9O60706 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.75
ABCC9O60706 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.5■■■■□ 3.75
ABCC9O60706 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC38.5■■■■□ 3.75
ABCC9O60706 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC38.5■■■■□ 3.75
ABCC9O60706 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC38.5■■■■□ 3.75
ABCC9O60706 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
ABCC9O60706 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC38.5■■■■□ 3.75
ABCC9O60706 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
ABCC9O60706 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.5■■■■□ 3.75
ABCC9O60706 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.49■■■■□ 3.75
ABCC9O60706 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC38.49■■■■□ 3.75
ABCC9O60706 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC38.49■■■■□ 3.75
ABCC9O60706 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC38.49■■■■□ 3.75
ABCC9O60706 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
ABCC9O60706 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.49■■■■□ 3.75
ABCC9O60706 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
ABCC9O60706 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC38.49■■■■□ 3.75
ABCC9O60706 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
ABCC9O60706 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC38.49■■■■□ 3.75
ABCC9O60706 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
ABCC9O60706 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.48■■■■□ 3.75
ABCC9O60706 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC38.48■■■■□ 3.75
ABCC9O60706 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC38.48■■■■□ 3.75
ABCC9O60706 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC38.48■■■■□ 3.75
ABCC9O60706 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms