Protein–RNA interactions for Protein: O60231

DHX16, Putative pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,041 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX16O60231 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DHX16O60231 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DHX16O60231 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DHX16O60231 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DHX16O60231 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DHX16O60231 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
DHX16O60231 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DHX16O60231 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DHX16O60231 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
DHX16O60231 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DHX16O60231 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DHX16O60231 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DHX16O60231 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DHX16O60231 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DHX16O60231 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DHX16O60231 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DHX16O60231 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DHX16O60231 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DHX16O60231 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
DHX16O60231 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
DHX16O60231 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DHX16O60231 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DHX16O60231 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DHX16O60231 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DHX16O60231 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DHX16O60231 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DHX16O60231 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DHX16O60231 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
DHX16O60231 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DHX16O60231 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DHX16O60231 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DHX16O60231 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DHX16O60231 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DHX16O60231 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DHX16O60231 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
DHX16O60231 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DHX16O60231 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DHX16O60231 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
DHX16O60231 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
DHX16O60231 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DHX16O60231 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DHX16O60231 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DHX16O60231 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
DHX16O60231 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DHX16O60231 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DHX16O60231 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DHX16O60231 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
DHX16O60231 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
DHX16O60231 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
DHX16O60231 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
DHX16O60231 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
DHX16O60231 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
DHX16O60231 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DHX16O60231 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DHX16O60231 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DHX16O60231 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DHX16O60231 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DHX16O60231 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DHX16O60231 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DHX16O60231 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DHX16O60231 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DHX16O60231 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DHX16O60231 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DHX16O60231 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DHX16O60231 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DHX16O60231 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DHX16O60231 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
DHX16O60231 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DHX16O60231 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
DHX16O60231 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DHX16O60231 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DHX16O60231 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DHX16O60231 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DHX16O60231 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DHX16O60231 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DHX16O60231 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DHX16O60231 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DHX16O60231 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DHX16O60231 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DHX16O60231 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DHX16O60231 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DHX16O60231 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DHX16O60231 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DHX16O60231 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DHX16O60231 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DHX16O60231 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DHX16O60231 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DHX16O60231 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DHX16O60231 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DHX16O60231 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DHX16O60231 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DHX16O60231 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DHX16O60231 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DHX16O60231 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DHX16O60231 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DHX16O60231 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DHX16O60231 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DHX16O60231 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DHX16O60231 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DHX16O60231 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms