Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SYNMO15061 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SYNMO15061 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SYNMO15061 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SYNMO15061 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SYNMO15061 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SYNMO15061 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SYNMO15061 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SYNMO15061 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SYNMO15061 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SYNMO15061 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SYNMO15061 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SYNMO15061 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SYNMO15061 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SYNMO15061 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SYNMO15061 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SYNMO15061 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SYNMO15061 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SYNMO15061 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SYNMO15061 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SYNMO15061 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SYNMO15061 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SYNMO15061 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SYNMO15061 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SYNMO15061 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SYNMO15061 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SYNMO15061 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SYNMO15061 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SYNMO15061 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SYNMO15061 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SYNMO15061 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SYNMO15061 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SYNMO15061 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
SYNMO15061 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SYNMO15061 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SYNMO15061 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SYNMO15061 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SYNMO15061 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SYNMO15061 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SYNMO15061 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SYNMO15061 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SYNMO15061 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SYNMO15061 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SYNMO15061 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SYNMO15061 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SYNMO15061 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
SYNMO15061 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SYNMO15061 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SYNMO15061 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SYNMO15061 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SYNMO15061 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SYNMO15061 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SYNMO15061 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SYNMO15061 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SYNMO15061 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SYNMO15061 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SYNMO15061 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SYNMO15061 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SYNMO15061 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SYNMO15061 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SYNMO15061 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SYNMO15061 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SYNMO15061 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SYNMO15061 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SYNMO15061 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SYNMO15061 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SYNMO15061 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SYNMO15061 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SYNMO15061 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SYNMO15061 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SYNMO15061 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SYNMO15061 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SYNMO15061 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SYNMO15061 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SYNMO15061 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SYNMO15061 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SYNMO15061 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SYNMO15061 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SYNMO15061 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SYNMO15061 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SYNMO15061 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SYNMO15061 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SYNMO15061 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SYNMO15061 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SYNMO15061 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SYNMO15061 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SYNMO15061 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SYNMO15061 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SYNMO15061 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SYNMO15061 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SYNMO15061 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SYNMO15061 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SYNMO15061 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SYNMO15061 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SYNMO15061 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SYNMO15061 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SYNMO15061 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SYNMO15061 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SYNMO15061 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SYNMO15061 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms